Ailevi Akdeniz Ateşi Hastalarında İnterlökin-16(Il-16) ve Otoimmun Regülatör Genlerinin (Aire) Promotör Metilasyon Durumunun Araştırılması

Abstract

Giriş: Ailevi Akdeniz Ateşi(AAA) ülkemizde sık görülen, özellikle erişkinlerde ciddi morbidite ile seyreden, sebebi ve etiyopatogenezi hakkında henüz net bir fikir birliği sağlanamayan bir hastalıktır. Bu çalışmadaki amaç, AAA hastalarında otoimmün regülatör (AIRE) ve interlökin-16 (IL-16) gen polimorfizm sıklığını araştırmak ve sağlıklı popülasyon ile karşılaştırmaktır. Yöntem: Çalışmamıza Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi İç Hastalıkları Anabilim Dalı, Romatoloji Bilim Dalı Polikliniklerine başvuran 18 yaş üstü hastalar dahil edildi. Çalışmaya AAA tanısı olan 40 hasta ve sağlıklı 40 gönüllü dahil edildi. Alınan kan örneklerinden DNA izolasyon kiti kullanılarak elde edilen genomik DNA'ların DNA konsantrasyonları ve saflıkları nanodrop ile ölçüldü. Sonrasında, DNA örnekleri, bisülfit modifikasyon kiti kullanılarak modifiye edildi. Daha sonra metilasyona spesifik PCR yöntemiyle, metilasyona özgül dizayn edilen primerler kullanılarak AIRE ve IL-16 genlerinin promotör metilasyon profilleri belirlendi. Çalışmanın sonuçları istatistiksel analiz programı ile değerlendirildi. Sonuçlar: Hem AAA grubunda hem de sağlıklı kontrol grubunda çalışmaya katılan tüm bireylerde AIRE ve IL-16 genlerinin promotör bölgesi metile saptanmış olup, bu genlerin ifadesinin her iki grupta da farklılık göstermediği görülmüştür. Tartışma: AIRE ve IL-16 gen mutasyonlarının her ne kadar pek çok otoimmün hastalılığın patogenezinde rol oynadığı gösterilmişse de AAA hastalarında anlamlı fark gözlenmemiştir. Bulgular ışığında bakıldığında, AAA'nın patogenezinde otoimmunite rolünün zayıf olduğu sonucuna ulaşılmıştır. Anahtar kelimeler: Ailevi Akdeniz Ateşi (AAA), interlökin-16 (IL-16), otoimmün regülatör gen (AİRE)İntroduction: Familial Mediterranean Fever is a common disease in our country that can cause morbidities, especially in adults, and a clear consensus has not yet been reached about its cause and etiopathogenesis. This study aimed to determine the frequency of interleukin-16 (IL-16) and autoimmune regulator (AIRE) gene polimorphisms and to compare with healthy population. Method: Patients over the age of 18 who applied to Ondokuz Mayıs University Faculty of Medicine, Rheumatology Department polyclinics were included in our study. The study included 40 patients diagnosed with FMF and 40 healthy volunteers. DNA concentrations and purity of genomic DNAs obtained from blood samples using a DNA isolation kit were measured with a nanodrop. Afterwards, the DNA samples were modified using a bisulfite modification kit. Then, the promoter methylation profiles of AIRE and IL-16 genes were determined by using methylation-specific PCR method and primers designed specifically for methylation. The results of the study were evaluated with a statistical analysis program. Results: In both groups the IL-16 and AIRE genes identified as methylated, expression of this genes show no difference between this two group. Discussion: Although AIRE and IL-16 gene mutation have been shown to play a role in the pathogenesis of many autoimmune diseases, no significant difference was observed in FMF patients. Consequently, it was postulated the autoimmunity does not play a major role in FMF pathogenesis. Key words: Mediterranean familial fever (FMF),IL-16, autoimmune regulatory gene (AIRE)