Mesane Tümörlü Hastaların Kanlarında Epigenetik Biyobelirteçler Olarak Protokaderin Gen Ailesi Üyeleri PCDH8, PCDH10 ve PCDH17’nin Araştırılması

Abstract

Amaç: Çalışmanın amacı mesane tümörlü hastalarda vesağlıklı kontrollerde protokaderin gen ailesine ait olanprotokaderin 8 (PCDH8), protokaderin 10 (PCDH10) veprotokaderin 17 (PCDH17) genlerinin periferal kan DNAmetilasyon profillerini analiz ederek bu profillerin tümörspesifikolası etkilerini değerlendirmektir. Araştırılan üçgenin metilasyon profiliyle spesifik demografik ve/veyaklinikopatolojik veriler arasındaki olası ilişkininaraştırılması da çalışmanın ikinci hedefidir.Gereç ve Yöntemler: Mesane karsinomalı (n=80; düşükdereceli: 40, yüksek dereceli: 40) ve sağlıklı kontrollerin(n=40) periferal kan örneklerinden ekstrakte edilen genomikDNA promotor bölgelerinin hipermetilasyon analizi içinbisülfit modifikasyon ve metilasyon-spesifik PCR işleminemaruz bırakılmıştır.Bulgular: PCDH8 metilasyon profilinin yaşla birlikte artışgösterdiği gözlenmiştir. Neredeyse kontrollerin tamamındada bu genler bakımından kısmi metilasyon profilleribelirlendiği için hasta örneklerindeki PCDH10 ve PCDH17metilasyon paternleri bir farklılık oluşturmamakla beraberPCDH8 daha farklı bir kan epigenetik profili sergilemiştir.Sonuç: PCDH8 geninin kandaki metilasyon modelininyaşlanma süreciyle ilişkisi çalışmamızda gösterilmiştir.Mesane kanserindeki etkisi açısından daha kesin bir sonucavarabilmek için PCDH8’in kandaki metilasyon durumunundaha yüksek sayılı kohortta ve MethyLight gibi daha duyarlımetotlarla araştırılmasını tavsiye etmekteyiz.